青藏高原与西北干旱区33个湖泊表层沉积植物DNA数据

Data of plant DNA in surface sediments of 33 lakes in Qinghai-Tibetan Plateau and arid northwestern China


数据包括青藏高原与西北干旱区33个湖泊表层沉积物中植物DNA的原始测序文件。我们使用德国Qiagen公司的PowerMax土壤试剂盒提取DNA,并采用通用植物引物g-h (Taberlet et al., 2007) 对样品中叶绿体trnL (UAA) 内含子区的P6环进行PCR扩增,PCR产物随后送至瑞士Fasteris公司进行第二代高通量双端测序,测序仪器为Illumina NextSeq 550。数据质量分数Q30为81.97。


数据文件命名方式和使用方法

数据为fastq文件,建议使用OBITOOLS等生物信息学工具进行读取并分析,具体可参考:https://datadryad.org/stash/dataset/doi:10.5061/dryad.k6djh9w4r。


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数据的引用

刘兴起, 贾伟瀚. (2021). 青藏高原与西北干旱区33个湖泊表层沉积植物DNA数据. 时空三极环境大数据平台, DOI: 10.5061/dryad.k6djh9w4r.
[Liu, X., Jia, W. (2021). Data of plant DNA in surface sediments of 33 lakes in Qinghai-Tibetan Plateau and arid northwestern China. A Big Earth Data Platform for Three Poles, DOI: 10.5061/dryad.k6djh9w4r. ] (下载引用: RIS格式 | RIS英文格式 | Bibtex格式 | Bibtex英文格式 )

文章的引用

1. 贾伟瀚. (2020). 青藏高原与西北干旱区湖泊沉积物中植物DNA的现代过程研究. 北京: 首都师范大学.( 查看 | Bibtex格式)

2. Stoof-Leichsenring, K.R., Liu, S., Jia, W., Li, K., & La, P. (2020). Plant diversity in sedimentary dna obtained from high-latitude (siberia) and high-elevation lakes (china). Biodiversity Data Journal, 8, e57089.( 查看 | Bibtex格式)

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  • 共享方式: 开放获取
  • 数据时间描述: 现代
  • 元数据更新时间: 2022-04-19
联系信息
刘兴起   贾伟瀚  

分发方: 时空三极环境大数据平台

Email: poles@itpcas.ac.cn

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